Ook Jacob Hiegentlich ontvluchtte in mei 1940 'geduchter schade', zoals andere intellectuelen, die zich in de voorafgaande jaren duidelijk hadden uitgesproken over de barbarij van het nationaal-socialisme. Op 14 mei 1940, de dag waarop Rotterdam gebombardeerd werd, de dag waarop het Nederlandse leger capituleerde, de dag waarop koningin en regering naar Londen uitweken, op die dag pleegden de Amsterdamse journalist Emanuel Boekman zelfmoord en de Utrechtse hoogleraar Jacob van Gelderen. Op die dag ook nam de 38-jarige literator Menno ter Braak vergif in, waaraan hij nog diezelfde nacht overleed.
In diezelfde nacht ten slotte nam ook Jacob Hiegentlich,
33 jaar jong, vergif in. Hij bleef vier dagen buiten bewustzijn, tot hij op zaterdag 18 mei 1940 in het Wilhelminagasthuis te Amsterdam overleed.